Letošní trasa závodu Šilheřovický šlaušek 2016 doznala drobných změn a jako obvykle je k dispozici na serveru Bikemap.net, kde je možné vyexportovat i její GPS souřadnice. Trasa je stejná jak pro polo-orientační běžecký závod, tak pro všechny kategorie závodů horských kol. Závodníci v kategorii 40 km pojedou dva okruhy, závodníci v kategorii 20 km jedou pouze jeden okruh, stejně jako běžci, kteří absolvují jen jeden okruh.
Mapa dětského závodu je stejná jako v předchozích ročnících a najdete ji rovněž na Bikemap.net. Mladší chlapci a dívky v kategorii 6-10 let pojedou dvě kola (7 km), starší chlapci a dívky v kategorii 11-14 let pojedou kola čtyři (14 km).